Manara, Serena
Manara, Serena
A YEAR-LONG ENVIRONMENTAL SURVEILLANCE OF SARS-CoV-2: ESTIMATING THE EFFECTIVE REPRODUCTION NUMBER OF SARS-CoV-2 INFECTIONS USING WASTEWATER DATA (RWASTEWATER)
2023-01-01 La Rosa, G.; Veneri, C.; Poletti, P.; Manica, M.; Bonanno Ferraro, G.; Mancini, P.; Del Giudice, C.; Iaconelli, M.; Lucentini, L.; Cerroni, M.; Brandtner, D.; Rossi, M.; Grigioni, M.; D’Avenio, G.; Del Manso, M.; Riccardo, F.; Bella, A.; Pezzotti, P.; Palamara, A. T.; Agrimi, U.; Martuzzi, M.; Bucciarelli, Giuseppe; Torlontano, Paolo; Aprea, Giuseppe; Scattolini, Silvia; Scattolini, Silvia; D’Angelantonio, Daniela; Migliorati, Giacomo; La Bianca, Michele; Anna Cifarelli, Rosa; Palma, Achille; e Giuseppe Lauria, Giovanna La Vecchia; Brienza, Rosanna; Montenegro, Patrizia; Malacaria, Eduardo; Folino, Giuseppe; Iannone, Michelangelo; Casaburi, Filomena; Bulotta, Giorgia; Barillari, Emanuela; Dragone, Melania; Sacco, Iolanda; Tomaino, Carmine; Felicetta, Cristina; Calabria, Adelaide; Varcasia, Ottavia; Stefanizzi, Francesca; Vizza, Concetta; D’Argenzio, Angelo; Cossentino, Luigi; Olivares, Renato; Pizzolante, Antonio; Fusco, Giovanna; Tosco, Alessandra; Porta, Amalia; Pennino, Francesca; Maria, Triassi; Angelini, Paola; Gentili, Lisa; De Lellis, Laura; Nasci, Daniele; Alborali, Giovanni; Formenti, Nicoletta; Guarneri, Flavia; Fontani, Nadia; Nani, Giulia; Palumbo, Franca; Borlone, Gianluca; Guercio, Marco; Mariuz, Marika; Trani, Gabriella; Pariani, Anna; Ancona, Carla; Barca, Alessandra; Serio, Flavia; Antonella Giorgi, Doriana; Ferrante, Irene; Monfrinotti, Monica; Riosa, Silvia; Capparuccini, Valeria; Teresa Scicluna, Maria; Cersini, Antonella; Arizzi, Mariaconcetta; Cecchini, Giancarlo; Ottaviano, Claudio; Nicosia, Elena; Fontani, Nadia; Nani, Giulia; Palumbo, Franca; Borlone, Gianluca; Guercio, Marco; Grasselli, Elena; Allaria, Giorgia; Dondero, Lorenzo; Rispo, Francesca; Izzotti, Alberto; Maria Bertolotto, Rosa; Nicosia, Elena; Rosatto, Stefano; Bellisomi, Marta; Tomesani, Irene; Tiso, Micaela; Ammoni, Emanuela; Cereda, Danilo; Nadia Losio, Marina; Bertasi, Barbara; Oliva, Desdemona; Giovanna Guiso, Maria; Ferrari, Fabio; Mundo, Maria; Martines, Antonino; Castiglioni, Sara; Schiarea, Silvia; Salmoiraghi, Giulia; Antonelli, Manuela; Azzellino, Arianna; Malpei, Francesca; Turolla, Andrea; Binda, Sandro; Laura, Pellegrinelli; Primache, Valeria; Cocuzza, Clementina; Franzetti, Andrea; Musumeci, Rosario; Martinelli, Marianna; Bertanza, Giorgio; Luisa Callegari, Maria; Bolognini, Luigi; Filippetti, Fabio; Paniccia', Marta; Ciuti, Francesca; Briscolini, Sara; Magi, Silvia; Colitti, Michele; Montanaro, Carmen; Aprea, Giuseppe; Scattolini, Silvia; D’Angelantonio, Daniela; Migliorati, Giacomo; Grazia Cerroni, Maria; Griglio, Bartolomeo; Berruti, Renza; Cravero, Mauro; Costa, Angela; Bianchi, Manila; Decastelli, Lucia; Romano, Angelo; Tramuta, Clara; Carraro, Elisabetta; Pignata, Cristina; Bonetta, Silvia; Richiardi, Lisa; Di Vittorio, Giuseppe; Mongelli, Onofrio; De Giglio, Osvalda; Apollonio, Francesca; Triggiano, Francesco; Teresa Montagna, Maria; Ungaro, Nicola; Palermo, Mario; Massimo Maida, Carmelo; Mazzucco, Walter; De Grazia, Simona; Giammanco, Giovanni; Purpari, Giuseppa; Ferrante, Margherita; Agodi, Antonella; Barchitta, Martina; Cala', Piergiuseppe; Carducci, Annalaura; Verani, Marco; Federigi, Ileana; Lauretani, Giulia; Muzio, Sara; Ramazzotti, Matteo; Antonelli, Alberto; Santoro, Giovanni; Federici, Ermanno; Petricciuolo, Maya; Barigelli, Sofia; Ruffier, Mauro; Borney, Francesca; Grange, Eric; Damasco, Florida; Russo, Francesca; Pitter, Gisella; Groppi, Vanessa; Rigoli, Franco; Zampini, Marco; Baldovin, Tatjana; Amoruso, Irene; Zago, Lorella; Stenico, Alberta; Demetz, Lea; Pizzo, Francesco; Schiavuzzi, Alessandra; Mengon, Elena; Cadonna, Maria; Postinghel, Mattia; Cutrupi, Francesca; Foladori, Paola; Manara, Serena; Merler, S.; Suffredini, E.
A Year-long environmental surveillance of SARS-CoV-2: estimating the effective reproduction number of SARS-CoV-2 infections using wastewater data
2023-01-01 G., La Rosa; Veneri, C.; Poletti, P.; Manica, M.; Bonanno Ferraro, G.; Mancini, P.; Del Giudice, C.; Iaconelli, M.; Lucentini, L.; Cerroni, M.; Brandtner, D.; Rossi, M.; Grigioni, M.; D’Avenio, G.; Del Manso, M.; Riccardo, F.; Bella, A.; Pezzotti, P.; Palamara, A. T.; Agrimi, U.; Martuzzi, M.; Bucciarelli, Giuseppe; Torlontano, Paolo; Aprea, Giuseppe; Scattolini, Silvia; Scattolini, Silvia; D’Angelantonio, Daniela; Migliorati, Giacomo; La Bianca, Michele; Anna Cifarelli, Rosa; Palma, Achille; e Giuseppe Lauria, Giovanna La Vecchia; Brienza, Rosanna; Montenegro, Patrizia; Malacaria, Eduardo; Folino, Giuseppe; Iannone, Michelangelo; Casaburi, Filomena; Bulotta, Giorgia; Barillari, Emanuela; Dragone, Melania; Sacco, Iolanda; Tomaino, Carmine; Felicetta, Cristina; Calabria, Adelaide; Varcasia, Ottavia; Stefanizzi, Francesca; Vizza, Concetta; D’Argenzio, Angelo; Cossentino, Luigi; Olivares, Renato; Pizzolante, Antonio; Fusco, Giovanna; Tosco, Alessandra; Porta, Amalia; Pennino, Francesca; Maria, Triassi; Angelini, Paola; Gentili, Lisa; De Lellis, Laura; Nasci, Daniele; Alborali, Giovanni; Formenti, Nicoletta; Guarneri, Flavia; Fontani, Nadia; Nani, Giulia; Palumbo, Franca; Borlone, Gianluca; Guercio, Marco; Mariuz, Marika; Trani, Gabriella; Pariani, Anna; Ancona, Carla; Barca, Alessandra; Serio, Flavia; Antonella Giorgi, Doriana; Ferrante, Irene; Monfrinotti, Monica; Riosa, Silvia; Capparuccini, Valeria; Teresa Scicluna, Maria; Cersini, Antonella; Arizzi, Mariaconcetta; Cecchini, Giancarlo; Ottaviano, Claudio; Nicosia, Elena; Fontani, Nadia; Nani, Giulia; Palumbo, Franca; Borlone, Gianluca; Guercio, Marco; Grasselli, Elena; Allaria, Giorgia; Dondero, Lorenzo; Rispo, Francesca; Izzotti, Alberto; Maria Bertolotto, Rosa; Nicosia, Elena; Rosatto, Stefano; Bellisomi, Marta; Tomesani, Irene; Tiso, Micaela; Ammoni, Emanuela; Cereda, Danilo; Nadia Losio, Marina; Bertasi, Barbara; Oliva, Desdemona; Giovanna Guiso, Maria; Ferrari, Fabio; Mundo, Maria; Martines, Antonino; Castiglioni, Sara; Schiarea, Silvia; Salmoiraghi, Giulia; Antonelli, Manuela; Azzellino, Arianna; Malpei, Francesca; Turolla, Andrea; Binda, Sandro; Laura, Pellegrinelli; Primache, Valeria; Cocuzza, Clementina; Franzetti, Andrea; Musumeci, Rosario; Martinelli, Marianna; Bertanza, Giorgio; Luisa Callegari, Maria; Bolognini, Luigi; Filippetti, Fabio; Paniccia', Marta; Ciuti, Francesca; Briscolini, Sara; Magi, Silvia; Colitti, Michele; Montanaro, Carmen; Aprea, Giuseppe; Scattolini, Silvia; D’Angelantonio, Daniela; Migliorati, Giacomo; Grazia Cerroni, Maria; Griglio, Bartolomeo; Berruti, Renza; Cravero, Mauro; Costa, Angela; Bianchi, Manila; Decastelli, Lucia; Romano, Angelo; Tramuta, Clara; Carraro, Elisabetta; Pignata, Cristina; Bonetta, Silvia; Richiardi, Lisa; Di Vittorio, Giuseppe; Mongelli, Onofrio; De Giglio, Osvalda; Apollonio, Francesca; Triggiano, Francesco; Teresa Montagna, Maria; Ungaro, Nicola; Palermo, Mario; Massimo Maida, Carmelo; Mazzucco, Walter; De Grazia, Simona; Giammanco, Giovanni; Purpari, Giuseppa; Ferrante, Margherita; Agodi, Antonella; Barchitta, Martina; Cala', Piergiuseppe; Carducci, Annalaura; Verani, Marco; Federigi, Ileana; Lauretani, Giulia; Muzio, Sara; Ramazzotti, Matteo; Antonelli, Alberto; Santoro, Giovanni; Federici, Ermanno; Petricciuolo, Maya; Barigelli, Sofia; Ruffier, Mauro; Borney, Francesca; Grange, Eric; Damasco, Florida; Russo, Francesca; Pitter, Gisella; Groppi, Vanessa; Rigoli, Franco; Zampini, Marco; Baldovin, Tatjana; Amoruso, Irene; Zago, Lorella; Stenico, Alberta; Demetz, Lea; Pizzo, Francesco; Schiavuzzi, Alessandra; Mengon, Elena; Cadonna, Maria; Postinghel, Mattia; Cutrupi, Francesca; Foladori, Paola; Manara, Serena; Merler, S.; Suffredini (2023), E.
Analysis of 1321 Eubacterium rectale genomes from metagenomes uncovers complex phylogeographic population structure and subspecies functional adaptations
2020-01-01 Karcher, Nicolai; Pasolli, Edoardo; Asnicar, Francesco; Huang, Kun D.; Tett, Adrian; Manara, Serena; Armanini, Federica; Bain, Debbie; Duncan, Sylvia H.; Louis, Petra; Zolfo, Moreno; Manghi, Paolo; Valles-Colomer, Mireia; Raffaetà, Roberta; Rota-Stabelli, Omar; Collado, Maria Carmen; Zeller, Georg; Falush, Daniel; Maixner, Frank; Walker, Alan W.; Huttenhower, Curtis; Segata, Nicola
Coronaviruses and SARS-CoV-2 in sewerage and their removal: Step by step in wastewater treatment plants
2022-01-01 Foladori, P.; Cutrupi, F.; Cadonna, M.; Manara, S.
ENHANCING UNDERSTANDING OF SARS-CoV-2 VARIANTS USING WASTEWATER ANALYSIS: AN In-DEPTH 18-MONTH INVESTIGATION
2023-01-01 Mancini, P.; Suffredini, E.; Bonanno Ferraro, G.; Veneri, C.; Del Giudice, C.; Iaconelli, M.; Brandtner, D.; Lucentini, L.; Bucciarelli, Giuseppe; Torlontano, Paolo; Aprea, Giuseppe; Scattolini, Silvia; Scattolini, Silvia; D’Angelantonio, Daniela; Migliorati, Giacomo; La Bianca, Michele; Anna Cifarelli, Rosa; Palma, Achille; e Giuseppe Lauria, Giovanna La Vecchia; Brienza, Rosanna; Montenegro, Patrizia; Malacaria, Eduardo; Folino, Giuseppe; Iannone, Michelangelo; Casaburi, Filomena; Bulotta, Giorgia; Barillari, Emanuela; Dragone, Melania; Sacco, Iolanda; Tomaino, Carmine; Felicetta, Cristina; Calabria, Adelaide; Varcasia, Ottavia; Stefanizzi, Francesca; Vizza, Concetta; D’Argenzio, Angelo; Cossentino, Luigi; Olivares, Renato; Pizzolante, Antonio; Fusco, Giovanna; Tosco, Alessandra; Porta, Amalia; Pennino, Francesca; Maria, Triassi; Angelini, Paola; Gentili, Lisa; De Lellis, Laura; Nasci, Daniele; Alborali, Giovanni; Formenti, Nicoletta; Guarneri, Flavia; Fontani, Nadia; Nani, Giulia; Palumbo, Franca; Borlone, Gianluca; Guercio, Marco; Mariuz, Marika; Trani, Gabriella; Pariani, Anna; Ancona, Carla; Barca, Alessandra; Serio, Flavia; Antonella Giorgi, Doriana; Ferrante, Irene; Monfrinotti, Monica; Riosa, Silvia; Capparuccini, Valeria; Teresa Scicluna, Maria; Cersini, Antonella; Arizzi, Mariaconcetta; Cecchini, Giancarlo; Ottaviano, Claudio; Nicosia, Elena; Fontani, Nadia; Nani, Giulia; Palumbo, Franca; Borlone, Gianluca; Guercio, Marco; Grasselli, Elena; Allaria, Giorgia; Dondero, Lorenzo; Rispo, Francesca; Izzotti, Alberto; Maria Bertolotto, Rosa; Nicosia, Elena; Rosatto, Stefano; Bellisomi, Marta; Tomesani, Irene; Tiso, Micaela; Ammoni, Emanuela; Cereda, Danilo; Nadia Losio, Marina; Bertasi, Barbara; Oliva, Desdemona; Giovanna Guiso, Maria; Ferrari, Fabio; Mundo, Maria; Martines, Antonino; Castiglioni, Sara; Schiarea, Silvia; Salmoiraghi, Giulia; Antonelli, Manuela; Azzellino, Arianna; Malpei, Francesca; Turolla, Andrea; Binda, Sandro; Laura, Pellegrinelli; Primache, Valeria; Cocuzza, Clementina; Franzetti, Andrea; Musumeci, Rosario; Martinelli, Marianna; Bertanza, Giorgio; Luisa Callegari, Maria; Bolognini, Luigi; Filippetti, Fabio; Paniccia', Marta; Ciuti, Francesca; Briscolini, Sara; Magi, Silvia; Colitti, Michele; Montanaro, Carmen; Aprea, Giuseppe; Scattolini, Silvia; D’Angelantonio, Daniela; Migliorati, Giacomo; Grazia Cerroni, Maria; Griglio, Bartolomeo; Berruti, Renza; Cravero, Mauro; Costa, Angela; Bianchi, Manila; Decastelli, Lucia; Romano, Angelo; Tramuta, Clara; Carraro, Elisabetta; Pignata, Cristina; Bonetta, Silvia; Richiardi, Lisa; Di Vittorio, Giuseppe; Mongelli, Onofrio; De Giglio, Osvalda; Apollonio, Francesca; Triggiano, Francesco; Teresa Montagna, Maria; Ungaro, Nicola; Palermo, Mario; Massimo Maida, Carmelo; Mazzucco, Walter; De Grazia, Simona; Giammanco, Giovanni; Purpari, Giuseppa; Ferrante, Margherita; Agodi, Antonella; Barchitta, Martina; Cala', Piergiuseppe; Carducci, Annalaura; Verani, Marco; Federigi, Ileana; Lauretani, Giulia; Muzio, Sara; Ramazzotti, Matteo; Antonelli, Alberto; Santoro, Giovanni; Federici, Ermanno; Petricciuolo, Maya; Barigelli, Sofia; Ruffier, Mauro; Borney, Francesca; Grange, Eric; Damasco, Florida; Russo, Francesca; Pitter, Gisella; Groppi, Vanessa; Rigoli, Franco; Zampini, Marco; Baldovin, Tatjana; Amoruso, Irene; Zago, Lorella; Stenico, Alberta; Demetz, Lea; Pizzo, Francesco; Schiavuzzi, Alessandra; Mengon, Elena; Cadonna, Maria; Postinghel, Mattia; Cutrupi, Francesca; Foladori, Paola; Manara, Serena; La Rosa, G.
Evaluation of concentration procedures, sample pre-treatment, and storage condition for the detection of SARS-CoV-2 in wastewater
2023-01-01 Cutrupi, Francesca; Rossi, Michele; Cadonna, Maria; Poznanski, Elisa; Manara, Serena; Postinghel, Mattia; Palumbi, Giulia; Bellisomi, Marta; Nicosia, Elena; Allaria, Giorgia; Dondero, Lorenzo; Veneri, Carolina; Mancini, Pamela; Ferraro, Giusy Bonanno; Rosa, Giuseppina; Suffredini, Elisabetta; Foladori, Paola; Grasselli, Elena
Extensive Unexplored Human Microbiome Diversity Revealed by Over 150,000 Genomes from Metagenomes Spanning Age, Geography, and Lifestyle
2019-01-01 Pasolli, Edoardo; Asnicar, Francesco; Manara, Serena; Zolfo, Moreno; Karcher, Nicolai; Armanini, Federica; Beghini, Francesco; Manghi, Paolo; Tett, Adrian; Ghensi, Paolo; Collado, Maria Carmen; Rice, Benjamin L.; Dulong, Casey; Morgan, Xochitl C.; Golden, Christopher D.; Quince, Christopher; Huttenhower, Curtis; Segata, Nicola
Genomic diversity and ecology of human-associated Akkermansia species in the gut microbiome revealed by extensive metagenomic assembly
2021-01-01 Karcher, N.; Nigro, E.; Puncochar, M.; Blanco-Miguez, A.; Ciciani, M.; Manghi, P.; Zolfo, M.; Cumbo, F.; Manara, S.; Golzato, D.; Cereseto, A.; Arumugam, M.; Bui, T. P. N.; Tytgat, H. L. P.; Valles-Colomer, M.; de Vos, W. M.; Segata, N.
Intestinal Blastocystis is linked to healthier diets and more favorable cardiometabolic outcomes in 56,989 individuals from 32 countries
2024-01-01 Piperni, Elisa; Nguyen, Long H.; Manghi, Paolo; Kim, Hanseul; Pasolli, Edoardo; Andreu-Sánchez, Sergio; Arrè, Alberto; Bermingham, Kate M.; Blanco-Míguez, Aitor; Manara, Serena; Valles-Colomer, Mireia; Bakker, Elco; Busonero, Fabio; Davies, Richard; Fiorillo, Edoardo; Giordano, Francesca; Hadjigeorgiou, George; Leeming, Emily R.; Lobina, Monia; Masala, Marco; Maschio, Andrea; Mciver, Lauren J.; Pala, Mauro; Pitzalis, Maristella; Wolf, Jonathan; Fu, Jingyuan; Zhernakova, Alexandra; Cacciò, Simone M.; Cucca, Francesco; Berry, Sarah E.; Ercolini, Danilo; Chan, Andrew T.; Huttenhower, Curtis; Spector, Tim D.; Segata, Nicola; Asnicar, Francesco
Maternal and food microbial sources shape the infant microbiome of a rural Ethiopian population
2023-01-01 Manara, Serena; Selma-Royo, Marta; Huang, Kun D; Asnicar, Francesco; Armanini, Federica; Blanco-Miguez, Aitor; Cumbo, Fabio; Golzato, Davide; Manghi, Paolo; Pinto, Federica; Valles-Colomer, Mireia; Amoroso, Loredana; Corrias, Maria Valeria; Ponzoni, Mirco; Raffaetà, Roberta; Cabrera-Rubio, Raul; Olcina, Mari; Pasolli, Edoardo; Collado, Maria Carmen; Segata, Nicola
Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation
2019-01-01 Thomas, Andrew Maltez; Manghi, Paolo; Asnicar, Francesco; Pasolli, Edoardo; Armanini, Federica; Zolfo, Moreno; Beghini, Francesco; Manara, Serena; Karcher, Nicolai; Pozzi, Chiara; Gandini, Sara; Serrano, Davide; Tarallo, Sonia; Francavilla, Antonio; Gallo, Gaetano; Trompetto, Mario; Ferrero, Giulio; Mizutani, Sayaka; Shiroma, Hirotsugu; Shiba, Satoshi; Shibata, Tatsuhiro; Yachida, Shinichi; Yamada, Takuji; Wirbel, Jakob; Schrotz-King, Petra; Ulrich, Cornelia M.; Brenner, Hermann; Arumugam, Manimozhiyan; Bork, Peer; Zeller, Georg; Cordero, Francesca; Dias-Neto, Emmanuel; Setubal, João Carlos; Tett, Adrian; Pardini, Barbara; Rescigno, Maria; Waldron, Levi; Naccarati, Alessio; Segata, Nicola
MetaPhlAn 4 profiling of unknown species-level genome bins improves the characterization of diet-associated microbiome changes in mice
2023-01-01 Manghi, Paolo; Blanco-Míguez, Aitor; Manara, Serena; Nabinejad, Amir; Cumbo, Fabio; Beghini, Francesco; Armanini, Federica; Golzato, Davide; Huang, Kun D; Thomas, Andrew M; Piccinno, Gianmarco; Punčochář, Michal; Zolfo, Moreno; Lesker, Till R; Bredon, Marius; Planchais, Julien; Glodt, Jeremy; Valles-Colomer, Mireia; Koren, Omry; Pasolli, Edoardo; Asnicar, Francesco; Strowig, Till; Sokol, Harry; Segata, Nicola
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus eradication in cystic fibrosis patients: A randomized multicenter study
2019-01-01 Dolce, D.; Neri, S.; Grisotto, L.; Campana, S.; Ravenni, N.; Miselli, F.; Camera, E.; Zavataro, L.; Braggion, C.; Fiscarelli, E. V.; Lucidi, V.; Cariani, L.; Girelli, D.; Faelli, N.; Colombo, C.; Lucanto, C.; Lombardo, M.; Magazzu, G.; Tosco, A.; Raia, V.; Manara, S.; Pasolli, E.; Armanini, F.; Segata, N.; Biggeri, A.; Taccetti, G.
Microbial genomes from non-human primate gut metagenomes expand the primate-associated bacterial tree of life with over 1000 novel species
2019-01-01 Manara, Serena; Asnicar, Francesco; Beghini, Francesco; Bazzani, Davide; Cumbo, Fabio; Zolfo, Moreno; Nigro, Eleonora; Karcher, Nicolai; Manghi, Paolo; Metzger, Marisa Isabell; Pasolli, Edoardo; Segata, Nicola
Mother-to-Infant Microbial Transmission from Different Body Sites Shapes the Developing Infant Gut Microbiome
2018-01-01 Ferretti, Pamela; Pasolli, Edoardo; Tett, Adrian; Asnicar, Francesco; Gorfer, Valentina; Fedi, Sabina; Armanini, Federica; Truong, Duy Tin; Manara, Serena; Zolfo, Moreno; Beghini, Francesco; Bertorelli, Roberto; De Sanctis, Veronica; Bariletti, Ilaria; Canto, Rosarita; Clementi, Rosanna; Cologna, Marina; Crifò, Tiziana; Cusumano, Giuseppina; Gottardi, Stefania; Innamorati, Claudia; Masè, Caterina; Postai, Daniela; Savoi, Daniela; Duranti, Sabrina; Lugli, Gabriele Andrea; Mancabelli, Leonardo; Turroni, Francesca; Ferrario, Chiara; Milani, Christian; Mangifesta, Marta; Anzalone, Rosaria; Viappiani, Alice; Yassour, Moran; Vlamakis, Hera; Xavier, Ramnik; Collado, Carmen Maria; Koren, Omry; Tateo, Saverio; Soffiati, Massimo; Pedrotti, Anna; Ventura, Marco; Huttenhower, Curtis; Bork, Peer; Segata, Nicola
Precise phylogenetic analysis of microbial isolates and genomes from metagenomes using PhyloPhlAn 3.0
2020-01-01 Asnicar, Francesco; Thomas, Andrew Maltez; Beghini, Francesco; Mengoni, Claudia; Manara, Serena; Manghi, Paolo; Zhu, Qiyun; Bolzan, Mattia; Cumbo, Fabio; May, Uyen; Sanders, Jon G.; Zolfo, Moreno; Kopylova, Evguenia; Pasolli, Edoardo; Knight, Rob; Mirarab, Siavash; Huttenhower, Curtis; Segata, Nicola
Route of SARS-CoV-2 in Sewerage and Wastewater Treatment Plants: Dilution, Decay, Removal, and Environmental Transmission
2021-01-01 Foladori, Paola; Cutrupi, Francesca; Cadonna, Maria; Manara, Serena; Maestrini, Federica
SARS-CoV-2 from Faeces to Wastewater Treatment: What Do We Know? A Review
2020-01-01 Foladori, Paola; Cutrupi, Francesca; Segata, Nicola; Manara, Serena; Pinto, Federica; Malpei, Francesca; Bruni, Laura; La Rosa, Giuseppina
Strain-level (meta)genomic profiling of bacteria from hospital pathogens to non-human primate commensals
2019-10-30 Manara, Serena
Studying Vertical Microbiome Transmission from Mothers to Infants by Strain-Level Metagenomic Profiling
2017-01-01 Asnicar, Francesco; Manara, Serena; Zolfo, Moreno; Truong, Duy Tin; Scholz, Matthias Uwe; Armanini, Federica; Ferretti, Pamela; Gorfer, Valentina; Pedrotti, Anna; Tett, Adrian James; Segata, Nicola