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Microbiome connections with host metabolism and habitual diet from 1,098 deeply phenotyped individuals 1-gen-2021 Asnicar, FrancescoPiccinno, GianmarcoValles-Colomer, MireiaTett, AdrianBeghini, FrancescoDubois, LéonardThomas, Andrew MaltezWaldron, LeviSegata, Nicola +
Integrating taxonomic, functional, and strain-level profiling of diverse microbial communities with bioBakery 3 1-gen-2021 Beghini, FrancescoBlanco-Míguez, AitorDubois, LeonardAsnicar, FrancescoManghi, PaoloScholz, MatthiasThomas, Andrew MaltezValles-Colomer, MireiaZolfo, MorenoSegata, Nicola +
The person-to-person transmission landscape of the gut and oral microbiomes 1-gen-2023 Valles-Colomer, MireiaManghi, PaoloAsnicar, FrancescoDubois, LeonardGolzato, DavideArmanini, FedericaCumbo, FabioManara, SerenaMasetti, GiuliaPinto, FedericaPiperni, ElisaRicci, LivianaZolfo, MorenoSelma-Royo, MartaFilosi, MicheleTett, AdrianPasolli, EdoardoDomenici, EnricoSegata, Nicola +
Extending and improving metagenomic taxonomic profiling with uncharacterized species using MetaPhlAn 4 1-gen-2023 Beghini, FrancescoCumbo, FabioZolfo, MorenoManghi, PaoloDubois, LeonardThomas, Andrew MaltezPiccinno, GianmarcoPiperni, ElisaValles-Colomer, MireiaTett, AdrianPasolli, EdoardoAsnicar, FrancescoSegata, Nicola +
Phylogenetic and functional characterization of human microbiome intra-species diversity and tracking of early-life transmission 27-lug-2023 Dubois, Leonard
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