Ciani, Yari
Ciani, Yari
CIBIO (29/10/12-)
ABEMUS: platform specific and data informed detection of somatic SNVs in cfDNA
2020-01-01 Casiraghi, Nicola; Orlando, Francesco; Ciani, Yari; Xiang, Jenny; Sboner, Andrea; Elemento, Olivier; Attard, Gerhardt; Beltran, Himisha; Demichelis, Francesca; Romanel, Alessandro
Allele-specific genomic data elucidate the role of somatic gain and copy-number neutral loss of heterozygosity in cancer
2022-01-01 Ciani, Y.; Fedrizzi, T.; Prandi, D.; Lorenzin, F.; Locallo, A.; Gasperini, P.; Franceschini, G. M.; Benelli, M.; Elemento, O.; Fava, L.; Inga, A.; Demichelis, F.
Circulating RNAs in prostate cancer patients
2022-01-01 Mugoni, V.; Ciani, Y.; Nardella, C.; Demichelis, F.
Fast mutual exclusivity algorithm nominates potential synthetic lethal gene pairs through brute force matrix product computations
2021-01-01 Fedrizzi, T.; Ciani, Y.; Lorenzin, F.; Cantore, T.; Gasperini, P.; Demichelis, F.
Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping
2020-01-01 Ramilowski, J. A.; Yip, C. W.; Agrawal, S.; Chang, J. -C.; Ciani, Y.; Kulakovskiy, I. V.; Mendez, M.; Ooi, J. L. C.; Ouyang, J. F.; Parkinson, N.; Petri, A.; Roos, L.; Severin, J.; Yasuzawa, K.; Abugessaisa, I.; Akalin, A.; Antonov, I. V.; Arner, E.; Bonetti, A.; Bono, H.; Borsari, B.; Brombacher, F.; Cameron, C. J. F.; Cannistraci, C. V.; Cardenas, R.; Cardon, M.; Chang, H.; Dostie, J.; Ducoli, L.; Favorov, A.; Fort, A.; Garrido, D.; Gil, N.; Gimenez, J.; Guler, R.; Handoko, L.; Harshbarger, J.; Hasegawa, A.; Hasegawa, Y.; Hashimoto, K.; Hayatsu, N.; Heutink, P.; Hirose, T.; Imada, E. L.; Itoh, M.; Kaczkowski, B.; Kanhere, A.; Kawabata, E.; Kawaji, H.; Kawashima, T.; Kelly, S. T.; Kojima, M.; Kondo, N.; Koseki, H.; Kouno, T.; Kratz, A.; Kurowska-Stolarska, M.; Kwon, A. T. J.; Leek, J.; Lennartsson, A.; Lizio, M.; Lopez-Redondo, F.; Luginbuhl, J.; Maeda, S.; Makeev, V. J.; Marchionni, L.; Medvedeva, Y. A.; Minoda, A.; Muller, F.; Munoz-Aguirre, M.; Murata, M.; Nishiyori, H.; Nitta, K. R.; Noguchi, S.; Noro, Y.; Nurtdinov, R.; Okazaki, Y.; Orlando, V.; Paquette, D.; Parr, C. J. C.; Rackham, O. J. L.; Rizzu, P.; Martinez, D. F. S.; Sandelin, A.; Sanjana, P.; Semple, C. A. M.; Shibayama, Y.; Sivaraman, D. M.; Suzuki, T.; Szumowski, S. C.; Tagami, M.; Taylor, M. S.; Terao, C.; Thodberg, M.; Thongjuea, S.; Tripathi, V.; Ulitsky, I.; Verardo, R.; Vorontsov, I. E.; Yamamoto, C.; Young, R. S.; Baillie, J. K.; Forrest, A. R. R.; Guigo, R.; Hoffman, M. M.; Hon, C. C.; Kasukawa, T.; Kauppinen, S.; Kere, J.; Lenhard, B.; Schneider, C.; Suzuki, H.; Yagi, K.; De Hoon, M. J. L.; Shin, J. W.; Carninci, P.
High-throughput assessment of the antibody profile in ovarian cancer ascitic fluids
2019-01-01 Antony, F.; Deantonio, C.; Cotella, D.; Soluri, M. F.; Tarasiuk, O.; Raspagliesi, F.; Adorni, F.; Piazza, S.; Ciani, Y.; Santoro, C.; Macor, P.; Mezzanzanica, D.; Sblattero, D.
Integrating extracellular vesicle and circulating cell-free DNA analysis on a single plasma aliquot improves the detection of HER2 positivity in breast cancer patients
2023-01-01 Mugoni, Vera; Ciani, Yari; Quaini, Orsetta; Tomasini, Simone; Notarangelo, Michela; Vannuccini, Federico; Marinelli, Alessia; Leonardi, Elena; Pontalti, Stefano; Martinelli, Angela; Rossetto, Daniele; Pesce, Isabella; Mansy, Sheref S.; Barbareschi, Mattia; Ferro, Antonella; Caffo, Orazio; Attard, Gerhardt; Di Vizio, Dolores; D'Agostino, Vito Giuseppe; Nardella, Caterina; Demichelis, Francesca
International Society for Extracellular Vesicles Workshop. QuantitatEVs: multiscale analyses, from bulk to single extracellular vesicle
2024-01-01 Basso, Manuela; Gori, Alessandro; Nardella, Caterina; Palviainen, Mari; Holcar, Marija; Sotiropoulos, Ioannis; Bobis-Wozowicz, Sylwia; D'Agostino, Vito G; Casarotto, Elena; Ciani, Yari; Suetsugu, Shiro; Gualerzi, Alice; Martin-Jaular, Lorena; Boselli, Daniela; Kashkanova, Anna; Parisse, Pietro; Lippens, Lien; Pagliuca, Martina; Blessing, Martin; Frigerio, Roberto; Fourniols, Thibaut; Meliciano, Ana; Fietta, Anna; Fioretti, Paolo Vincenzo; Soroczyńska, Karolina; Picciolini, Silvia; Salviano-Silva, Amanda; Bergese, Paolo; Zocco, Davide; Chiari, Marcella; Jenster, Guido; Waldron, Levi; Milosavljevic, Aleksandar; Nolan, John; Monopoli, Marco P; Witwer, Kenneth W; Bussolati, Benedetta; Di Vizio, Dolores; Falcon Perez, Juan; Lenassi, Metka; Cretich, Marina; Demichelis, Francesca
Noninvasive Detection of Neuroendocrine Prostate Cancer through Targeted Cell-free DNA Methylation
2024-01-01 Franceschini, Gian Marco; Quaini, Orsetta; Mizuno, Kei; Orlando, Francesco; Ciani, Yari; Ku, Sheng-Yu; Sigouros, Michael; Rothmann, Emily; Alonso, Alicia; Benelli, Matteo; Nardella, Caterina; Auh, Joonghoon; Freeman, Dory; Hanratty, Brian; Adil, Mohamed; Elemento, Olivier; Tagawa, Scott T.; Feng, Felix Y.; Caffo, Orazio; Buttigliero, Consuelo; Basso, Umberto; Nelson, Peter S.; Corey, Eva; Haffner, Michael C.; Attard, Gerhardt; Aparicio, Ana; Demichelis, Francesca; Beltran, Himisha
Sterile inflammation via TRPM8 RNA-dependent TLR3-NF-kB/IRF3 activation promotes antitumor immunity in prostate cancer
2024-01-01 Alaimo, Alessandro; Genovesi, Sacha; Annesi, Nicole; De Felice, Dario; Subedi, Saurav; Macchia, Alice; La Manna, Federico; Ciani, Yari; Vannuccini, Federico; Mugoni, Vera; Notarangelo, Michela; Libergoli, Michela; Broso, Francesca; Taulli, Riccardo; Ala, Ugo; Savino, Aurora; Cortese, Martina; Mirzaaghaei, Somayeh; Poli, Valeria; Bonapace, Ian Marc; Papotti, Mauro Giulio; Molinaro, Luca; Doglioni, Claudio; Caffo, Orazio; Anesi, Adriano; Nagler, Michael; Bertalot, Giovanni; Carbone, Francesco Giuseppe; Barbareschi, Mattia; Basso, Umberto; Dassi, Erik; Pizzato, Massimo; Romanel, Alessandro; Demichelis, Francesca; Kruithof-de Julio, Marianna; Lunardi, Andrea
Two distinct immunopathological profiles in autopsy lungs of COVID-19
2020-01-01 Nienhold, R; Ciani, Y; Koelzer, V; Tzankov, A; Haslbauer, J; Menter, T; Schwab, N; Henkel, M; Frank, A; Zsikla, V; Willi, N; Kempf, W; Hoyler, T; Barbareschi, M; Moch, H; Tolnay, M; Cathomas, G; Demichelis, Francesca; Mertz Kirsten, D.