Attenzione: i dati modificati non sono ancora stati salvati. Per confermare inserimenti o cancellazioni di voci è necessario confermare con il tasto SALVA/INSERISCI in fondo alla pagina
IRIS
Schizophrenia has a heritability of 60-80%1, much of which is attributable to common risk alleles. Here, in a two-stage genome-wide association study of up to 76,755 individuals with schizophrenia and 243,649 control individuals, we report common variant associations at 287 distinct genomic loci. Associations were concentrated in genes that are expressed in excitatory and inhibitory neurons of the central nervous system, but not in other tissues or cell types. Using fine-mapping and functional genomic data, we identify 120 genes (106 protein-coding) that are likely to underpin associations at some of these loci, including 16 genes with credible causal non-synonymous or untranslated region variation. We also implicate fundamental processes related to neuronal function, including synaptic organization, differentiation and transmission. Fine-mapped candidates were enriched for genes associated with rare disruptive coding variants in people with schizophrenia, including the glutamate receptor subunit GRIN2A and transcription factor SP4, and were also enriched for genes implicated by such variants in neurodevelopmental disorders. We identify biological processes relevant to schizophrenia pathophysiology; show convergence of common and rare variant associations in schizophrenia and neurodevelopmental disorders; and provide a resource of prioritized genes and variants to advance mechanistic studies.
Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia / Trubetskoy, V.; Pardinas, A. F.; Qi, T.; Panagiotaropoulou, G.; Awasthi, S.; Bigdeli, T. B.; Bryois, J.; Chen, C. -Y.; Dennison, C. A.; Hall, L. S.; Lam, M.; Watanabe, K.; Frei, O.; Ge, T.; Harwood, J. C.; Koopmans, F.; Magnusson, S.; Richards, A. L.; Sidorenko, J.; Wu, Y.; Zeng, J.; Grove, J.; Kim, M.; Li, Z.; Voloudakis, G.; Zhang, W.; Adams, M.; Agartz, I.; Atkinson, E. G.; Agerbo, E.; Al Eissa, M.; Albus, M.; Alexander, M.; Alizadeh, B. Z.; Alptekin, K.; Als, T. D.; Amin, F.; Arolt, V.; Arrojo, M.; Athanasiu, L.; Azevedo, M. H.; Bacanu, S. A.; Bass, N. J.; Begemann, M.; Belliveau, R. A.; Bene, J.; Benyamin, B.; Bergen, S. E.; Blasi, G.; Bobes, J.; Bonassi, S.; Braun, A.; Bressan, R. A.; Bromet, E. J.; Bruggeman, R.; Buckley, P. F.; Buckner, R. L.; Bybjerg-Grauholm, J.; Cahn, W.; Cairns, M. J.; Calkins, M. E.; Carr, V. J.; Castle, D.; Catts, S. V.; Chambert, K. D.; Chan, R. C. K.; Chaumette, B.; Cheng, W.; Cheung, E. F. C.; Chong, S. A.; Cohen, D.; Consoli, A.; Cordeiro, Q.; Costas, J.; Curtis, C.; Davidson, M.; Davis, K. L.; de Haan, L.; Degenhardt, F.; Delisi, L. E.; Demontis, D.; Dickerson, F.; Dikeos, D.; Dinan, T.; Djurovic, S.; Duan, J.; Ducci, G.; Dudbridge, F.; Eriksson, J. G.; Fananas, L.; Faraone, S. V.; Fiorentino, A.; Forstner, A.; Frank, J.; Freimer, N. B.; Fromer, M.; Frustaci, A.; Gadelha, A.; Genovese, G.; Gershon, E. S.; Giannitelli, M.; Giegling, I.; Giusti-Rodriguez, P.; Godard, S.; Goldstein, J. I.; Gonzalez Penas, J.; Gonzalez-Pinto, A.; Gopal, S.; Gratten, J.; Green, M. F.; Greenwood, T. A.; Guillin, O.; Guloksuz, S.; Gur, R. E.; Gur, R. C.; Gutierrez, B.; Hahn, E.; Hakonarson, H.; Haroutunian, V.; Hartmann, A. M.; Harvey, C.; Hayward, C.; Henskens, F. A.; Herms, S.; Hoffmann, P.; Howrigan, D. P.; Ikeda, M.; Iyegbe, C.; Joa, I.; Julia, A.; Kahler, A. K.; Kam-Thong, T.; Kamatani, Y.; Karachanak-Yankova, S.; Kebir, O.; Keller, M. C.; Kelly, B. J.; Khrunin, A.; Kim, S. -W.; Klovins, J.; Kondratiev, N.; Konte, B.; Kraft, J.; Kubo, M.; Kucinskas, V.; Kucinskiene, Z. A.; Kusumawardhani, A.; Kuzelova-Ptackova, H.; Landi, S.; Lazzeroni, L. C.; Lee, P. H.; Legge, S. E.; Lehrer, D. S.; Lencer, R.; Lerer, B.; Li, M.; Lieberman, J.; Light, G. A.; Limborska, S.; Liu, C. -M.; Lonnqvist, J.; Loughland, C. M.; Lubinski, J.; Luykx, J. J.; Lynham, A.; Macek, M.; Mackinnon, A.; Magnusson, P. K. E.; Maher, B. S.; Maier, W.; Malaspina, D.; Mallet, J.; Marder, S. R.; Marsal, S.; Martin, A. R.; Martorell, L.; Mattheisen, M.; Mccarley, R. W.; Mcdonald, C.; Mcgrath, J. J.; Medeiros, H.; Meier, S.; Melegh, B.; Melle, I.; Mesholam-Gately, R. I.; Metspalu, A.; Michie, P. T.; Milani, L.; Milanova, V.; Mitjans, M.; Molden, E.; Molina, E.; Molto, M. D.; Mondelli, V.; Moreno, C.; Morley, C. P.; Muntane, G.; Murphy, K. C.; Myin-Germeys, I.; Nenadic, I.; Nestadt, G.; Nikitina-Zake, L.; Noto, C.; Nuechterlein, K. H.; O'Brien, N. L.; O'Neill, F. A.; Oh, S. -Y.; Olincy, A.; Ota, V. K.; Pantelis, C.; Papadimitriou, G. N.; Parellada, M.; Paunio, T.; Pellegrino, R.; Periyasamy, S.; Perkins, D. O.; Pfuhlmann, B.; Pietilainen, O.; Pimm, J.; Porteous, D.; Powell, J.; Quattrone, D.; Quested, D.; Radant, A. D.; Rampino, A.; Rapaport, M. H.; Rautanen, A.; Reichenberg, A.; Roe, C.; Roffman, J. L.; Roth, J.; Rothermundt, M.; Rutten, B. P. F.; Saker-Delye, S.; Salomaa, V.; Sanjuan, J.; Santoro, M. L.; Savitz, A.; Schall, U.; Scott, R. J.; Seidman, L. J.; Sharp, S. I.; Shi, J.; Siever, L. J.; Sigurdsson, E.; Sim, K.; Skarabis, N.; Slominsky, P.; So, H. -C.; Sobell, J. L.; Soderman, E.; Stain, H. J.; Steen, N. E.; Steixner-Kumar, A. A.; Stogmann, E.; Stone, W. S.; Straub, R. E.; Streit, F.; Strengman, E.; Stroup, T. S.; Subramaniam, M.; Sugar, C. A.; Suvisaari, J.; Svrakic, D. M.; Swerdlow, N. R.; Szatkiewicz, J. P.; Ta, T. M. T.; Takahashi, A.; Terao, C.; Thibaut, F.; Toncheva, D.; Tooney, P. A.; Torretta, S.; Tosato, S.; Tura, G. B.; Turetsky, B. I.; Ucok, A.; Vaaler, A.; van Amelsvoort, T.; van Winkel, R.; Veijola, J.; Waddington, J.; Walter, H.; Waterreus, A.; Webb, B. T.; Weiser, M.; Williams, N. M.; Witt, S. H.; Wormley, B. K.; Wu, J. Q.; Xu, Z.; Yolken, R.; Zai, C. C.; Zhou, W.; Zhu, F.; Zimprich, F.; Atbasoglu, E. C.; Ayub, M.; Benner, C.; Bertolino, A.; Black, D. W.; Bray, N. J.; Breen, G.; Buccola, N. G.; Byerley, W. F.; Chen, W. J.; Cloninger, C. R.; Crespo-Facorro, B.; Donohoe, G.; Freedman, R.; Galletly, C.; Gandal, M. J.; Gennarelli, M.; Hougaard, D. M.; Hwu, H. -G.; Jablensky, A. V.; Mccarroll, S. A.; Moran, J. L.; Mors, O.; Mortensen, P. B.; Muller-Myhsok, B.; Neil, A. L.; Nordentoft, M.; Pato, M. T.; Petryshen, T. L.; Pirinen, M.; Pulver, A. E.; Schulze, T. G.; Silverman, J. M.; Smoller, J. W.; Stahl, E. A.; Tsuang, D. W.; Vilella, E.; Wang, S. -H.; Xu, S.; Dai, N.; Wenwen, Q.; Wildenauer, D. B.; Agiananda, F.; Amir, N.; Antoni, R.; Arsianti, T.; Asmarahadi, A.; Diatri, H.; Djatmiko, P.; Irmansyah, I.; Khalimah, S.; Kusumadewi, I.; Kusumaningrum, P.; Lukman, P. R.; Nasrun, M. W.; Safyuni, N. S.; Prasetyawan, P.; Semen, G.; Siste, K.; Tobing, H.; Widiasih, N.; Wiguna, T.; Wulandari, D.; Evalina, N.; Hananto, A. J.; Ismoyo, J. H.; Marini, T. M.; Henuhili, S.; Reza, M.; Yusnadewi, S.; Abyzov, A.; Akbarian, S.; Ashley-Koch, A.; van Bakel, H.; Breen, M.; Brown, M.; Bryois, J.; Carlyle, B.; Charney, A.; Coetzee, G.; Crawford, G.; Dracheva, S.; Emani, P.; Farnham, P.; Fromer, M.; Galeev, T.; Gandal, M.; Gerstein, M.; Giase, G.; Girdhar, K.; Goes, F.; Grennan, K.; Gu, M.; Guerra, B.; Gursoy, G.; Hoffman, G.; Hyde, T.; Jaffe, A.; Jiang, S.; Jiang, Y.; Kefi, A.; Kim, Y.; Kitchen, R.; Knowles, J. A.; Lay, F.; Lee, D.; Li, M.; Liu, C.; Liu, S.; Mattei, E.; Navarro, F.; Pan, X.; Peters, M. A.; Pinto, D.; Pochareddy, S.; Polioudakis, D.; Purcaro, M.; Purcell, S.; Pratt, H.; Reddy, T.; Rhie, S.; Roussos, P.; Rozowsky, J.; Sanders, S.; Sestan, N.; Sethi, A.; Shi, X.; Shieh, A.; Swarup, V.; Szekely, A.; Wang, D.; Warrell, J.; Weissman, S.; Weng, Z.; White, K.; Wiseman, J.; Witt, H.; Won, H.; Wood, S.; Wu, F.; Xu, X.; Yao, L.; Zandi, P.; Arranz, M. J.; Bakker, S.; Bender, S.; Bramon, E.; Collier, D. A.; Crepo-Facorro, B.; Hall, J.; Iyegbe, C.; Kahn, R.; Lawrie, S.; Lewis, C.; Lin, K.; Linszen, D. H.; Mata, I.; Mcintosh, A.; Murray, R. M.; Ophoff, R. A.; van Os, J.; Powell, J.; Rujescu, D.; Walshe, M.; Weisbrod, M.; Achsel, T.; Andres-Alonso, M.; Bagni, C.; Bayes, A.; Biederer, T.; Brose, N.; Brown, T. C.; Chua, J. J. E.; Coba, M. P.; Cornelisse, L. N.; de Jong, A. P. H.; de Juan-Sanz, J.; Dieterich, D. C.; Feng, G.; Goldschmidt, H. L.; Gundelfinger, E. D.; Hoogenraad, C.; Huganir, R. L.; Hyman, S. E.; Imig, C.; Jahn, R.; Jung, H.; Kaeser, P. S.; Kim, E.; Koopmans, F.; Kreutz, M. R.; Lipstein, N.; Macgillavry, H. D.; Malenka, R.; Mcpherson, P. S.; O'Connor, V.; Pielot, R.; Ryan, T. A.; Sahasrabudhe, D.; Sala, C.; Sheng, M.; Smalla, K. -H.; Smit, A. B.; Sudhof, T. C.; Thomas, P. D.; Toonen, R. F.; van Weering, J. R. T.; Verhage, M.; Verpelli, C.; Adolfsson, R.; Arango, C.; Baune, B. T.; Belangero, S. I.; Borglum, A. D.; Braff, D.; Bramon, E.; Buxbaum, J. D.; Campion, D.; Cervilla, J. A.; Cichon, S.; Collier, D. A.; Corvin, A.; Curtis, D.; Forti, M. D.; Domenici, E.; Ehrenreich, H.; Escott-Price, V.; Esko, T.; Fanous, A. H.; Gareeva, A.; Gawlik, M.; Gejman, P. V.; Gill, M.; Glatt, S. J.; Golimbet, V.; Hong, K. S.; Hultman, C. M.; Hyman, S. E.; Iwata, N.; Jonsson, E. G.; Kahn, R. S.; Kennedy, J. L.; Khusnutdinova, E.; Kirov, G.; Knowles, J. A.; Krebs, M. -O.; Laurent-Levinson, C.; Lee, J.; Lencz, T.; Levinson, D. F.; Li, Q. S.; Liu, J.; Malhotra, A. K.; Malhotra, D.; Mcintosh, A.; Mcquillin, A.; Menezes, P. R.; Morgan, V. A.; Morris, D. W.; Mowry, B. J.; Murray, R. M.; Nimgaonkar, V.; Nothen, M. M.; Ophoff, R. A.; Paciga, S. A.; Palotie, A.; Pato, C. N.; Qin, S.; Rietschel, M.; Riley, B. P.; Rivera, M.; Rujescu, D.; Saka, M. C.; Sanders, A. R.; Schwab, S. G.; Serretti, A.; Sham, P. C.; Shi, Y.; St Clair, D.; Stefansson, H.; Stefansson, K.; Tsuang, M. T.; van Os, J.; Vawter, M. P.; Weinberger, D. R.; Werge, T.; Wildenauer, D. B.; Yu, X.; Yue, W.; Holmans, P. A.; Pocklington, A. J.; Roussos, P.; Vassos, E.; Verhage, M.; Visscher, P. M.; Yang, J.; Posthuma, D.; Andreassen, O. A.; Kendler, K. S.; Owen, M. J.; Wray, N. R.; Daly, M. J.; Huang, H.; Neale, B. M.; Sullivan, P. F.; Ripke, S.; Walters, J. T. R.; O'Donovan, M. C.; de Haan, L.; van Amelsvoort, T.; van Winkel, R.; Gareeva, A.; Sham, P. C.; Shi, Y.; St Clair, D.; van Os, J.. - In: NATURE. - ISSN 1476-4687. - 604:7906(2022), pp. 502-508. [10.1038/s41586-022-04434-5]
Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia
Trubetskoy V.;Pardinas A. F.;Qi T.;Panagiotaropoulou G.;Awasthi S.;Bigdeli T. B.;Bryois J.;Chen C. -Y.;Dennison C. A.;Hall L. S.;Lam M.;Watanabe K.;Frei O.;Ge T.;Harwood J. C.;Koopmans F.;Magnusson S.;Richards A. L.;Sidorenko J.;Wu Y.;Zeng J.;Grove J.;Kim M.;Li Z.;Voloudakis G.;Zhang W.;Adams M.;Agartz I.;Atkinson E. G.;Agerbo E.;Al Eissa M.;Albus M.;Alexander M.;Alizadeh B. Z.;Alptekin K.;Als T. D.;Amin F.;Arolt V.;Arrojo M.;Athanasiu L.;Azevedo M. H.;Bacanu S. A.;Bass N. J.;Begemann M.;Belliveau R. A.;Bene J.;Benyamin B.;Bergen S. E.;Blasi G.;Bobes J.;Bonassi S.;Braun A.;Bressan R. A.;Bromet E. J.;Bruggeman R.;Buckley P. F.;Buckner R. L.;Bybjerg-Grauholm J.;Cahn W.;Cairns M. J.;Calkins M. E.;Carr V. J.;Castle D.;Catts S. V.;Chambert K. D.;Chan R. C. K.;Chaumette B.;Cheng W.;Cheung E. F. C.;Chong S. A.;Cohen D.;Consoli A.;Cordeiro Q.;Costas J.;Curtis C.;Davidson M.;Davis K. L.;de Haan L.;Degenhardt F.;DeLisi L. E.;Demontis D.;Dickerson F.;Dikeos D.;Dinan T.;Djurovic S.;Duan J.;Ducci G.;Dudbridge F.;Eriksson J. G.;Fananas L.;Faraone S. V.;Fiorentino A.;Forstner A.;Frank J.;Freimer N. B.;Fromer M.;Frustaci A.;Gadelha A.;Genovese G.;Gershon E. S.;Giannitelli M.;Giegling I.;Giusti-Rodriguez P.;Godard S.;Goldstein J. I.;Gonzalez Penas J.;Gonzalez-Pinto A.;Gopal S.;Gratten J.;Green M. F.;Greenwood T. A.;Guillin O.;Guloksuz S.;Gur R. E.;Gur R. C.;Gutierrez B.;Hahn E.;Hakonarson H.;Haroutunian V.;Hartmann A. M.;Harvey C.;Hayward C.;Henskens F. A.;Herms S.;Hoffmann P.;Howrigan D. P.;Ikeda M.;Iyegbe C.;Joa I.;Julia A.;Kahler A. K.;Kam-Thong T.;Kamatani Y.;Karachanak-Yankova S.;Kebir O.;Keller M. C.;Kelly B. J.;Khrunin A.;Kim S. -W.;Klovins J.;Kondratiev N.;Konte B.;Kraft J.;Kubo M.;Kucinskas V.;Kucinskiene Z. A.;Kusumawardhani A.;Kuzelova-Ptackova H.;Landi S.;Lazzeroni L. C.;Lee P. H.;Legge S. E.;Lehrer D. S.;Lencer R.;Lerer B.;Li M.;Lieberman J.;Light G. A.;Limborska S.;Liu C. -M.;Lonnqvist J.;Loughland C. M.;Lubinski J.;Luykx J. J.;Lynham A.;Macek M.;Mackinnon A.;Magnusson P. K. E.;Maher B. S.;Maier W.;Malaspina D.;Mallet J.;Marder S. R.;Marsal S.;Martin A. R.;Martorell L.;Mattheisen M.;McCarley R. W.;McDonald C.;McGrath J. J.;Medeiros H.;Meier S.;Melegh B.;Melle I.;Mesholam-Gately R. I.;Metspalu A.;Michie P. T.;Milani L.;Milanova V.;Mitjans M.;Molden E.;Molina E.;Molto M. D.;Mondelli V.;Moreno C.;Morley C. P.;Muntane G.;Murphy K. C.;Myin-Germeys I.;Nenadic I.;Nestadt G.;Nikitina-Zake L.;Noto C.;Nuechterlein K. H.;O'Brien N. L.;O'Neill F. A.;Oh S. -Y.;Olincy A.;Ota V. K.;Pantelis C.;Papadimitriou G. N.;Parellada M.;Paunio T.;Pellegrino R.;Periyasamy S.;Perkins D. O.;Pfuhlmann B.;Pietilainen O.;Pimm J.;Porteous D.;Powell J.;Quattrone D.;Quested D.;Radant A. D.;Rampino A.;Rapaport M. H.;Rautanen A.;Reichenberg A.;Roe C.;Roffman J. L.;Roth J.;Rothermundt M.;Rutten B. P. F.;Saker-Delye S.;Salomaa V.;Sanjuan J.;Santoro M. L.;Savitz A.;Schall U.;Scott R. J.;Seidman L. J.;Sharp S. I.;Shi J.;Siever L. J.;Sigurdsson E.;Sim K.;Skarabis N.;Slominsky P.;So H. -C.;Sobell J. L.;Soderman E.;Stain H. J.;Steen N. E.;Steixner-Kumar A. A.;Stogmann E.;Stone W. S.;Straub R. E.;Streit F.;Strengman E.;Stroup T. S.;Subramaniam M.;Sugar C. A.;Suvisaari J.;Svrakic D. M.;Swerdlow N. R.;Szatkiewicz J. P.;Ta T. M. T.;Takahashi A.;Terao C.;Thibaut F.;Toncheva D.;Tooney P. A.;Torretta S.;Tosato S.;Tura G. B.;Turetsky B. I.;Ucok A.;Vaaler A.;van Amelsvoort T.;van Winkel R.;Veijola J.;Waddington J.;Walter H.;Waterreus A.;Webb B. T.;Weiser M.;Williams N. M.;Witt S. H.;Wormley B. K.;Wu J. Q.;Xu Z.;Yolken R.;Zai C. C.;Zhou W.;Zhu F.;Zimprich F.;Atbasoglu E. C.;Ayub M.;Benner C.;Bertolino A.;Black D. W.;Bray N. J.;Breen G.;Buccola N. G.;Byerley W. F.;Chen W. J.;Cloninger C. R.;Crespo-Facorro B.;Donohoe G.;Freedman R.;Galletly C.;Gandal M. J.;Gennarelli M.;Hougaard D. M.;Hwu H. -G.;Jablensky A. V.;McCarroll S. A.;Moran J. L.;Mors O.;Mortensen P. B.;Muller-Myhsok B.;Neil A. L.;Nordentoft M.;Pato M. T.;Petryshen T. L.;Pirinen M.;Pulver A. E.;Schulze T. G.;Silverman J. M.;Smoller J. W.;Stahl E. A.;Tsuang D. W.;Vilella E.;Wang S. -H.;Xu S.;Dai N.;Wenwen Q.;Wildenauer D. B.;Agiananda F.;Amir N.;Antoni R.;Arsianti T.;Asmarahadi A.;Diatri H.;Djatmiko P.;Irmansyah I.;Khalimah S.;Kusumadewi I.;Kusumaningrum P.;Lukman P. R.;Nasrun M. W.;Safyuni N. S.;Prasetyawan P.;Semen G.;Siste K.;Tobing H.;Widiasih N.;Wiguna T.;Wulandari D.;Evalina N.;Hananto A. J.;Ismoyo J. H.;Marini T. M.;Henuhili S.;Reza M.;Yusnadewi S.;Abyzov A.;Akbarian S.;Ashley-Koch A.;van Bakel H.;Breen M.;Brown M.;Bryois J.;Carlyle B.;Charney A.;Coetzee G.;Crawford G.;Dracheva S.;Emani P.;Farnham P.;Fromer M.;Galeev T.;Gandal M.;Gerstein M.;Giase G.;Girdhar K.;Goes F.;Grennan K.;Gu M.;Guerra B.;Gursoy G.;Hoffman G.;Hyde T.;Jaffe A.;Jiang S.;Jiang Y.;Kefi A.;Kim Y.;Kitchen R.;Knowles J. A.;Lay F.;Lee D.;Li M.;Liu C.;Liu S.;Mattei E.;Navarro F.;Pan X.;Peters M. A.;Pinto D.;Pochareddy S.;Polioudakis D.;Purcaro M.;Purcell S.;Pratt H.;Reddy T.;Rhie S.;Roussos P.;Rozowsky J.;Sanders S.;Sestan N.;Sethi A.;Shi X.;Shieh A.;Swarup V.;Szekely A.;Wang D.;Warrell J.;Weissman S.;Weng Z.;White K.;Wiseman J.;Witt H.;Won H.;Wood S.;Wu F.;Xu X.;Yao L.;Zandi P.;Arranz M. J.;Bakker S.;Bender S.;Bramon E.;Collier D. A.;Crepo-Facorro B.;Hall J.;Iyegbe C.;Kahn R.;Lawrie S.;Lewis C.;Lin K.;Linszen D. H.;Mata I.;McIntosh A.;Murray R. M.;Ophoff R. A.;van Os J.;Powell J.;Rujescu D.;Walshe M.;Weisbrod M.;Achsel T.;Andres-Alonso M.;Bagni C.;Bayes A.;Biederer T.;Brose N.;Brown T. C.;Chua J. J. E.;Coba M. P.;Cornelisse L. N.;de Jong A. P. H.;de Juan-Sanz J.;Dieterich D. C.;Feng G.;Goldschmidt H. L.;Gundelfinger E. D.;Hoogenraad C.;Huganir R. L.;Hyman S. E.;Imig C.;Jahn R.;Jung H.;Kaeser P. S.;Kim E.;Koopmans F.;Kreutz M. R.;Lipstein N.;MacGillavry H. D.;Malenka R.;McPherson P. S.;O'Connor V.;Pielot R.;Ryan T. A.;Sahasrabudhe D.;Sala C.;Sheng M.;Smalla K. -H.;Smit A. B.;Sudhof T. C.;Thomas P. D.;Toonen R. F.;van Weering J. R. T.;Verhage M.;Verpelli C.;Adolfsson R.;Arango C.;Baune B. T.;Belangero S. I.;Borglum A. D.;Braff D.;Bramon E.;Buxbaum J. D.;Campion D.;Cervilla J. A.;Cichon S.;Collier D. A.;Corvin A.;Curtis D.;Forti M. D.;Domenici E.;Ehrenreich H.;Escott-Price V.;Esko T.;Fanous A. H.;Gareeva A.;Gawlik M.;Gejman P. V.;Gill M.;Glatt S. J.;Golimbet V.;Hong K. S.;Hultman C. M.;Hyman S. E.;Iwata N.;Jonsson E. G.;Kahn R. S.;Kennedy J. L.;Khusnutdinova E.;Kirov G.;Knowles J. A.;Krebs M. -O.;Laurent-Levinson C.;Lee J.;Lencz T.;Levinson D. F.;Li Q. S.;Liu J.;Malhotra A. K.;Malhotra D.;McIntosh A.;McQuillin A.;Menezes P. R.;Morgan V. A.;Morris D. W.;Mowry B. J.;Murray R. M.;Nimgaonkar V.;Nothen M. M.;Ophoff R. A.;Paciga S. A.;Palotie A.;Pato C. N.;Qin S.;Rietschel M.;Riley B. P.;Rivera M.;Rujescu D.;Saka M. C.;Sanders A. R.;Schwab S. G.;Serretti A.;Sham P. C.;Shi Y.;St Clair D.;Stefansson H.;Stefansson K.;Tsuang M. T.;van Os J.;Vawter M. P.;Weinberger D. R.;Werge T.;Wildenauer D. B.;Yu X.;Yue W.;Holmans P. A.;Pocklington A. J.;Roussos P.;Vassos E.;Verhage M.;Visscher P. M.;Yang J.;Posthuma D.;Andreassen O. A.;Kendler K. S.;Owen M. J.;Wray N. R.;Daly M. J.;Huang H.;Neale B. M.;Sullivan P. F.;Ripke S.;Walters J. T. R.;O'Donovan M. C.;de Haan L.;van Amelsvoort T.;van Winkel R.;Gareeva A.;Sham P. C.;Shi Y.;St Clair D.;van Os J.
2022-01-01
Abstract
Schizophrenia has a heritability of 60-80%1, much of which is attributable to common risk alleles. Here, in a two-stage genome-wide association study of up to 76,755 individuals with schizophrenia and 243,649 control individuals, we report common variant associations at 287 distinct genomic loci. Associations were concentrated in genes that are expressed in excitatory and inhibitory neurons of the central nervous system, but not in other tissues or cell types. Using fine-mapping and functional genomic data, we identify 120 genes (106 protein-coding) that are likely to underpin associations at some of these loci, including 16 genes with credible causal non-synonymous or untranslated region variation. We also implicate fundamental processes related to neuronal function, including synaptic organization, differentiation and transmission. Fine-mapped candidates were enriched for genes associated with rare disruptive coding variants in people with schizophrenia, including the glutamate receptor subunit GRIN2A and transcription factor SP4, and were also enriched for genes implicated by such variants in neurodevelopmental disorders. We identify biological processes relevant to schizophrenia pathophysiology; show convergence of common and rare variant associations in schizophrenia and neurodevelopmental disorders; and provide a resource of prioritized genes and variants to advance mechanistic studies.
Trubetskoy, V.; Pardinas, A. F.; Qi, T.; Panagiotaropoulou, G.; Awasthi, S.; Bigdeli, T. B.; Bryois, J.; Chen, C. -Y.; Dennison, C. A.; Hall, L. S.; L...espandi
Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia / Trubetskoy, V.; Pardinas, A. F.; Qi, T.; Panagiotaropoulou, G.; Awasthi, S.; Bigdeli, T. B.; Bryois, J.; Chen, C. -Y.; Dennison, C. A.; Hall, L. S.; Lam, M.; Watanabe, K.; Frei, O.; Ge, T.; Harwood, J. C.; Koopmans, F.; Magnusson, S.; Richards, A. L.; Sidorenko, J.; Wu, Y.; Zeng, J.; Grove, J.; Kim, M.; Li, Z.; Voloudakis, G.; Zhang, W.; Adams, M.; Agartz, I.; Atkinson, E. G.; Agerbo, E.; Al Eissa, M.; Albus, M.; Alexander, M.; Alizadeh, B. Z.; Alptekin, K.; Als, T. D.; Amin, F.; Arolt, V.; Arrojo, M.; Athanasiu, L.; Azevedo, M. H.; Bacanu, S. A.; Bass, N. J.; Begemann, M.; Belliveau, R. A.; Bene, J.; Benyamin, B.; Bergen, S. E.; Blasi, G.; Bobes, J.; Bonassi, S.; Braun, A.; Bressan, R. A.; Bromet, E. J.; Bruggeman, R.; Buckley, P. F.; Buckner, R. L.; Bybjerg-Grauholm, J.; Cahn, W.; Cairns, M. J.; Calkins, M. E.; Carr, V. J.; Castle, D.; Catts, S. V.; Chambert, K. D.; Chan, R. C. K.; Chaumette, B.; Cheng, W.; Cheung, E. F. C.; Chong, S. A.; Cohen, D.; Consoli, A.; Cordeiro, Q.; Costas, J.; Curtis, C.; Davidson, M.; Davis, K. L.; de Haan, L.; Degenhardt, F.; Delisi, L. E.; Demontis, D.; Dickerson, F.; Dikeos, D.; Dinan, T.; Djurovic, S.; Duan, J.; Ducci, G.; Dudbridge, F.; Eriksson, J. G.; Fananas, L.; Faraone, S. V.; Fiorentino, A.; Forstner, A.; Frank, J.; Freimer, N. B.; Fromer, M.; Frustaci, A.; Gadelha, A.; Genovese, G.; Gershon, E. S.; Giannitelli, M.; Giegling, I.; Giusti-Rodriguez, P.; Godard, S.; Goldstein, J. I.; Gonzalez Penas, J.; Gonzalez-Pinto, A.; Gopal, S.; Gratten, J.; Green, M. F.; Greenwood, T. A.; Guillin, O.; Guloksuz, S.; Gur, R. E.; Gur, R. C.; Gutierrez, B.; Hahn, E.; Hakonarson, H.; Haroutunian, V.; Hartmann, A. M.; Harvey, C.; Hayward, C.; Henskens, F. A.; Herms, S.; Hoffmann, P.; Howrigan, D. P.; Ikeda, M.; Iyegbe, C.; Joa, I.; Julia, A.; Kahler, A. K.; Kam-Thong, T.; Kamatani, Y.; Karachanak-Yankova, S.; Kebir, O.; Keller, M. C.; Kelly, B. J.; Khrunin, A.; Kim, S. -W.; Klovins, J.; Kondratiev, N.; Konte, B.; Kraft, J.; Kubo, M.; Kucinskas, V.; Kucinskiene, Z. A.; Kusumawardhani, A.; Kuzelova-Ptackova, H.; Landi, S.; Lazzeroni, L. C.; Lee, P. H.; Legge, S. E.; Lehrer, D. S.; Lencer, R.; Lerer, B.; Li, M.; Lieberman, J.; Light, G. A.; Limborska, S.; Liu, C. -M.; Lonnqvist, J.; Loughland, C. M.; Lubinski, J.; Luykx, J. J.; Lynham, A.; Macek, M.; Mackinnon, A.; Magnusson, P. K. E.; Maher, B. S.; Maier, W.; Malaspina, D.; Mallet, J.; Marder, S. R.; Marsal, S.; Martin, A. R.; Martorell, L.; Mattheisen, M.; Mccarley, R. W.; Mcdonald, C.; Mcgrath, J. J.; Medeiros, H.; Meier, S.; Melegh, B.; Melle, I.; Mesholam-Gately, R. I.; Metspalu, A.; Michie, P. T.; Milani, L.; Milanova, V.; Mitjans, M.; Molden, E.; Molina, E.; Molto, M. D.; Mondelli, V.; Moreno, C.; Morley, C. P.; Muntane, G.; Murphy, K. C.; Myin-Germeys, I.; Nenadic, I.; Nestadt, G.; Nikitina-Zake, L.; Noto, C.; Nuechterlein, K. H.; O'Brien, N. L.; O'Neill, F. A.; Oh, S. -Y.; Olincy, A.; Ota, V. K.; Pantelis, C.; Papadimitriou, G. N.; Parellada, M.; Paunio, T.; Pellegrino, R.; Periyasamy, S.; Perkins, D. O.; Pfuhlmann, B.; Pietilainen, O.; Pimm, J.; Porteous, D.; Powell, J.; Quattrone, D.; Quested, D.; Radant, A. D.; Rampino, A.; Rapaport, M. H.; Rautanen, A.; Reichenberg, A.; Roe, C.; Roffman, J. L.; Roth, J.; Rothermundt, M.; Rutten, B. P. F.; Saker-Delye, S.; Salomaa, V.; Sanjuan, J.; Santoro, M. L.; Savitz, A.; Schall, U.; Scott, R. J.; Seidman, L. J.; Sharp, S. I.; Shi, J.; Siever, L. J.; Sigurdsson, E.; Sim, K.; Skarabis, N.; Slominsky, P.; So, H. -C.; Sobell, J. L.; Soderman, E.; Stain, H. J.; Steen, N. E.; Steixner-Kumar, A. A.; Stogmann, E.; Stone, W. S.; Straub, R. E.; Streit, F.; Strengman, E.; Stroup, T. S.; Subramaniam, M.; Sugar, C. A.; Suvisaari, J.; Svrakic, D. M.; Swerdlow, N. R.; Szatkiewicz, J. P.; Ta, T. M. T.; Takahashi, A.; Terao, C.; Thibaut, F.; Toncheva, D.; Tooney, P. A.; Torretta, S.; Tosato, S.; Tura, G. B.; Turetsky, B. I.; Ucok, A.; Vaaler, A.; van Amelsvoort, T.; van Winkel, R.; Veijola, J.; Waddington, J.; Walter, H.; Waterreus, A.; Webb, B. T.; Weiser, M.; Williams, N. M.; Witt, S. H.; Wormley, B. K.; Wu, J. Q.; Xu, Z.; Yolken, R.; Zai, C. C.; Zhou, W.; Zhu, F.; Zimprich, F.; Atbasoglu, E. C.; Ayub, M.; Benner, C.; Bertolino, A.; Black, D. W.; Bray, N. J.; Breen, G.; Buccola, N. G.; Byerley, W. F.; Chen, W. J.; Cloninger, C. R.; Crespo-Facorro, B.; Donohoe, G.; Freedman, R.; Galletly, C.; Gandal, M. J.; Gennarelli, M.; Hougaard, D. M.; Hwu, H. -G.; Jablensky, A. V.; Mccarroll, S. A.; Moran, J. L.; Mors, O.; Mortensen, P. B.; Muller-Myhsok, B.; Neil, A. L.; Nordentoft, M.; Pato, M. T.; Petryshen, T. L.; Pirinen, M.; Pulver, A. E.; Schulze, T. G.; Silverman, J. M.; Smoller, J. W.; Stahl, E. A.; Tsuang, D. W.; Vilella, E.; Wang, S. -H.; Xu, S.; Dai, N.; Wenwen, Q.; Wildenauer, D. B.; Agiananda, F.; Amir, N.; Antoni, R.; Arsianti, T.; Asmarahadi, A.; Diatri, H.; Djatmiko, P.; Irmansyah, I.; Khalimah, S.; Kusumadewi, I.; Kusumaningrum, P.; Lukman, P. R.; Nasrun, M. W.; Safyuni, N. S.; Prasetyawan, P.; Semen, G.; Siste, K.; Tobing, H.; Widiasih, N.; Wiguna, T.; Wulandari, D.; Evalina, N.; Hananto, A. J.; Ismoyo, J. H.; Marini, T. M.; Henuhili, S.; Reza, M.; Yusnadewi, S.; Abyzov, A.; Akbarian, S.; Ashley-Koch, A.; van Bakel, H.; Breen, M.; Brown, M.; Bryois, J.; Carlyle, B.; Charney, A.; Coetzee, G.; Crawford, G.; Dracheva, S.; Emani, P.; Farnham, P.; Fromer, M.; Galeev, T.; Gandal, M.; Gerstein, M.; Giase, G.; Girdhar, K.; Goes, F.; Grennan, K.; Gu, M.; Guerra, B.; Gursoy, G.; Hoffman, G.; Hyde, T.; Jaffe, A.; Jiang, S.; Jiang, Y.; Kefi, A.; Kim, Y.; Kitchen, R.; Knowles, J. A.; Lay, F.; Lee, D.; Li, M.; Liu, C.; Liu, S.; Mattei, E.; Navarro, F.; Pan, X.; Peters, M. A.; Pinto, D.; Pochareddy, S.; Polioudakis, D.; Purcaro, M.; Purcell, S.; Pratt, H.; Reddy, T.; Rhie, S.; Roussos, P.; Rozowsky, J.; Sanders, S.; Sestan, N.; Sethi, A.; Shi, X.; Shieh, A.; Swarup, V.; Szekely, A.; Wang, D.; Warrell, J.; Weissman, S.; Weng, Z.; White, K.; Wiseman, J.; Witt, H.; Won, H.; Wood, S.; Wu, F.; Xu, X.; Yao, L.; Zandi, P.; Arranz, M. J.; Bakker, S.; Bender, S.; Bramon, E.; Collier, D. A.; Crepo-Facorro, B.; Hall, J.; Iyegbe, C.; Kahn, R.; Lawrie, S.; Lewis, C.; Lin, K.; Linszen, D. H.; Mata, I.; Mcintosh, A.; Murray, R. M.; Ophoff, R. A.; van Os, J.; Powell, J.; Rujescu, D.; Walshe, M.; Weisbrod, M.; Achsel, T.; Andres-Alonso, M.; Bagni, C.; Bayes, A.; Biederer, T.; Brose, N.; Brown, T. C.; Chua, J. J. E.; Coba, M. P.; Cornelisse, L. N.; de Jong, A. P. H.; de Juan-Sanz, J.; Dieterich, D. C.; Feng, G.; Goldschmidt, H. L.; Gundelfinger, E. D.; Hoogenraad, C.; Huganir, R. L.; Hyman, S. E.; Imig, C.; Jahn, R.; Jung, H.; Kaeser, P. S.; Kim, E.; Koopmans, F.; Kreutz, M. R.; Lipstein, N.; Macgillavry, H. D.; Malenka, R.; Mcpherson, P. S.; O'Connor, V.; Pielot, R.; Ryan, T. A.; Sahasrabudhe, D.; Sala, C.; Sheng, M.; Smalla, K. -H.; Smit, A. B.; Sudhof, T. C.; Thomas, P. D.; Toonen, R. F.; van Weering, J. R. T.; Verhage, M.; Verpelli, C.; Adolfsson, R.; Arango, C.; Baune, B. T.; Belangero, S. I.; Borglum, A. D.; Braff, D.; Bramon, E.; Buxbaum, J. D.; Campion, D.; Cervilla, J. A.; Cichon, S.; Collier, D. A.; Corvin, A.; Curtis, D.; Forti, M. D.; Domenici, E.; Ehrenreich, H.; Escott-Price, V.; Esko, T.; Fanous, A. H.; Gareeva, A.; Gawlik, M.; Gejman, P. V.; Gill, M.; Glatt, S. J.; Golimbet, V.; Hong, K. S.; Hultman, C. M.; Hyman, S. E.; Iwata, N.; Jonsson, E. G.; Kahn, R. S.; Kennedy, J. L.; Khusnutdinova, E.; Kirov, G.; Knowles, J. A.; Krebs, M. -O.; Laurent-Levinson, C.; Lee, J.; Lencz, T.; Levinson, D. F.; Li, Q. S.; Liu, J.; Malhotra, A. K.; Malhotra, D.; Mcintosh, A.; Mcquillin, A.; Menezes, P. R.; Morgan, V. A.; Morris, D. W.; Mowry, B. J.; Murray, R. M.; Nimgaonkar, V.; Nothen, M. M.; Ophoff, R. A.; Paciga, S. A.; Palotie, A.; Pato, C. N.; Qin, S.; Rietschel, M.; Riley, B. P.; Rivera, M.; Rujescu, D.; Saka, M. C.; Sanders, A. R.; Schwab, S. G.; Serretti, A.; Sham, P. C.; Shi, Y.; St Clair, D.; Stefansson, H.; Stefansson, K.; Tsuang, M. T.; van Os, J.; Vawter, M. P.; Weinberger, D. R.; Werge, T.; Wildenauer, D. B.; Yu, X.; Yue, W.; Holmans, P. A.; Pocklington, A. J.; Roussos, P.; Vassos, E.; Verhage, M.; Visscher, P. M.; Yang, J.; Posthuma, D.; Andreassen, O. A.; Kendler, K. S.; Owen, M. J.; Wray, N. R.; Daly, M. J.; Huang, H.; Neale, B. M.; Sullivan, P. F.; Ripke, S.; Walters, J. T. R.; O'Donovan, M. C.; de Haan, L.; van Amelsvoort, T.; van Winkel, R.; Gareeva, A.; Sham, P. C.; Shi, Y.; St Clair, D.; van Os, J.. - In: NATURE. - ISSN 1476-4687. - 604:7906(2022), pp. 502-508. [10.1038/s41586-022-04434-5]
I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione
Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11572/354015
Citazioni
710
971
946
ND
social impact
Conferma cancellazione
Sei sicuro che questo prodotto debba essere cancellato?
simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
